Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
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NCOA1Q15788 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
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NCOA1Q15788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
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NCOA1Q15788 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NCOA1Q15788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCOA1Q15788 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
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