Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRRQ15256 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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PTPRRQ15256 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRRQ15256 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRRQ15256 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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