Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCD11Q14690 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCD11Q14690 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms