Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SEMA3AQ14563 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SEMA3AQ14563 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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