Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM25Q14258 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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