Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCARF1Q14162 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCARF1Q14162 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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