Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMB3Q13751 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMB3Q13751 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMB3Q13751 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMB3Q13751 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms