Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL4BQ13620 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL4BQ13620 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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