Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CUL4AQ13619 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4AQ13619 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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