Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATRQ13535 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATRQ13535 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATRQ13535 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATRQ13535 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATRQ13535 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms