Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXE3Q13461 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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