Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGADQ13349 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms