Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFFO1Q0D2I5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms