Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE4DQ08499 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE4DQ08499 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms