Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP3CAQ08209 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms