Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SRSF11Q05519 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF11Q05519 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms