Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYP27A1Q02318 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP27A1Q02318 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms