Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A3Q01959 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A3Q01959 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms