Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDC42EP1Q00587 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC42EP1Q00587 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms