Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUCB2P80303 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUCB2P80303 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms