Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ELF3P78545 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ELF3P78545 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ELF3P78545 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ELF3P78545 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ELF3P78545 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ELF3P78545 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms