Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT85P78386 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT85P78386 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT85P78386 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT85P78386 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT85P78386 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT85P78386 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT85P78386 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT85P78386 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT85P78386 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT85P78386 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT85P78386 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT85P78386 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms