Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HBBP68871 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HBBP68871 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HBBP68871 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HBBP68871 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HBBP68871 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms