Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM258P61165 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TMEM258P61165 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms