Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF4A1P60842 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
EIF4A1P60842 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms