Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN1P60606 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTXN1P60606 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms