Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
ROMO1P60602 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
ROMO1P60602 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms