Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHMP4BP1P59074 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHMP4BP1P59074 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms