Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LINC01547P58512 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
LINC01547P58512 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms