Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMDP57764 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMDP57764 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms