Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
AP2S1P53680 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AP2S1P53680 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms