Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ARFIP1P53367 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms