Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LUMP51884 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LUMP51884 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LUMP51884 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LUMP51884 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LUMP51884 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LUMP51884 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LUMP51884 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LUMP51884 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LUMP51884 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LUMP51884 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LUMP51884 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms