Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLCNKBP51801 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLCNKBP51801 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms