Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNA2P51530 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNA2P51530 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNA2P51530 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNA2P51530 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNA2P51530 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNA2P51530 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNA2P51530 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms