Protein–RNA interactions for Protein: P50135

HNMT, Histamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNMTP50135 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HNMTP50135 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HNMTP50135 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HNMTP50135 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HNMTP50135 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HNMTP50135 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HNMTP50135 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HNMTP50135 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms