Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK2P49760 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK2P49760 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK2P49760 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK2P49760 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms