Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM25P49756 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM25P49756 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBM25P49756 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBM25P49756 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBM25P49756 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBM25P49756 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBM25P49756 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RBM25P49756 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RBM25P49756 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM25P49756 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM25P49756 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM25P49756 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RBM25P49756 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms