Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TTPAP49638 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTPAP49638 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTPAP49638 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTPAP49638 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTPAP49638 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TTPAP49638 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTPAP49638 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTPAP49638 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms