Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NESP48681 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NESP48681 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
NESP48681 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NESP48681 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NESP48681 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NESP48681 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NESP48681 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NESP48681 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NESP48681 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NESP48681 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NESP48681 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
NESP48681 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NESP48681 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms