Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUP62P37198 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUP62P37198 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUP62P37198 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP62P37198 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP62P37198 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUP62P37198 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP62P37198 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms