Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACVR1BP36896 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACVR1BP36896 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms