Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT3P35638 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDIT3P35638 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDIT3P35638 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms