Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFC1P35251 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFC1P35251 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFC1P35251 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFC1P35251 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms