Protein–RNA interactions for Protein: P34096

RNASE4, Ribonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASE4P34096 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNASE4P34096 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RNASE4P34096 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms