Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MIPP30301 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MIPP30301 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MIPP30301 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPP30301 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPP30301 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPP30301 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPP30301 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MIPP30301 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MIPP30301 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MIPP30301 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MIPP30301 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MIPP30301 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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