Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTGFP29279 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTGFP29279 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTGFP29279 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTGFP29279 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTGFP29279 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms