Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPRMP28827 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
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