Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBL1P28749 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBL1P28749 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBL1P28749 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBL1P28749 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBL1P28749 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBL1P28749 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBL1P28749 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBL1P28749 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms