Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HTR2AP28223 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HTR2AP28223 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms